По договорам с юридическими и физическими лицами производится очистка предоставленных в пользование участков акватории водохранилищ от древесного хлама и мусора.
Работы производятся на закрепленных водохранилищах Водораздельного бьефа канала им. Москвы (Клязьминское, Пестовское, Пяловское, Икшинское) и Москворецкой водной системы (Истринское, Рузское, Озернинское, Можайское).
Очистка осуществляется с использованием плавсредств учреждения в летний период, а также в зимний период после установления прочного ледового покрова с использованием снегоходов. Мусор собирается в пластиковые мешки и вывозится в места его утилизации.
Стоимость работ рассчитывается в зависимости от площади участка акватории или протяженности участка, подлежащего очистке вдоль береговой линии, по фактическим затратам.